熒光基團通常各自擁有單一的光吸收峰。在光的刺激下，熒光基團吸收光的能量后通常以三種方式釋放出能量：

　　1.光能：許多熒光基團吸收光能后仍舊以光能形式釋放能量，并且發(fā)射光的峰值大于吸收峰。

　　2.熱能：某些熒光基團吸收光能后，能量轉換為熱量擴散到環(huán)境中。

　　3.轉移給臨近的分子：當臨近的分子滿(mǎn)足發(fā)生能量轉移的要求時(shí)，能量從熒光基團傳遞到臨近的分子。

　　當某個(gè)熒光基團的發(fā)射譜與另一熒光基團的吸收光譜發(fā)生重疊，且兩個(gè)基團距離足夠近時(shí)，能量可以從短波長(cháng)（高能量）的熒光基團傳遞到長(cháng)波長(cháng)（低能量）的熒光基團，這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為熒光共振能量轉移(FRET)，實(shí)際相當于將短波長(cháng)熒光基團釋放的熒光屏蔽。

　　熒光-PCR法區別于其他PCR法主要有以下優(yōu)點(diǎn)：

　　1.全封閉反應，無(wú)需PCR后處理；

　　2.特異性強，靈敏度高；

　　3.采用對數期分析，摒棄終點(diǎn)數據，定量準確；

　　4.定量范圍寬，可達到10個(gè)數量級；

　　5.儀器在線(xiàn)式實(shí)時(shí)監測，結果直觀(guān)，避免人為判斷；

　　6.可實(shí)現一管雙檢或多檢；

　　7.操作安全，縮短時(shí)間，提高效率；

　　8.利于自動(dòng)化和聯(lián)網(wǎng)管理。